戈那瑞林主要用于诊断下丘脑-垂体-生殖腺功能障碍，治疗闭经与促性腺激素分泌不足和多滤泡性卵巢引起的不孕症。戈那瑞林或其同类物布舍瑞林、戈舍瑞林、亮丙瑞林、那法瑞林和曲普瑞林还可用于避孕、隐睾症、恶性肿瘤（尤其前列腺癌）、延迟的和提前的青春期。还可用于子宫内膜异位。戈那瑞林也用于促排卵以治疗下丘脑性闭经所致不孕、原发性卵巢功能不足，特别是对氯米芬无效的患者。